Публикации по теме 'bioinformatics'
Все, что вам нужно знать о публикации программного обеспечения на Bioconda
Публикация пакетов Python, связанных с биоинформатикой, на Bioconda
Были ли у вас проблемы с установкой пакетов и запуском огромного количества команд для установки зависимостей? Если вам повезет (в большинстве случаев вам не повезет), вы в конечном итоге установите пакет без каких-либо проблем с зависимостями или конфликтов версий. Работая в междисциплинарных науках, я понял, как сложно заставить эти инструменты работать, если вы не знаете, что на самом деле происходит с точки зрения..
Сегментация клеток в Институте Алана Тьюринга
20–12–2019
Мне посчастливилось попасть на декабрьский раунд Групп по изучению данных Института Алана Тьюринга в Британской библиотеке здесь, в Лондоне. Это 5-дневный хакатон, на котором вы будете работать над большими, интересными (и часто засекреченными) наборами данных. Идея состоит в том, что эти данные связаны с реальными проблемами, которые имеют значительное влияние.
Проекты
В этом туре у нас были проекты от DSTL , WWF и Национального архива среди прочих. Я был очень..
Предсказание структуры белка с помощью AlphaFold2
Всем привет! Меня зовут Дима и здесь я хочу поделиться своим небольшим проектом. Речь идет о внедрении инструмента глубокого обучения в предсказание структуры белка. Наслаждаться!
Эта небольшая научно-техническая статья должна начинаться с краткого рассказа о моей первой стажировке
В конце декабря 2021 года мне посчастливилось найти онлайн-стажировку в области биоинформатики. Это была стажировка NyBerMan Merit Internship от LLBio-IT School, и основное внимание было уделено,..
Как мы можем использовать Python и биопайтон для биоинформатической работы
Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) - это серия баз данных, в которых хранятся молекулярные и библиографические данные. С момента своего создания в 1988 году NCBI привлекла многих исследователей для доступа к своим молекулярным данным (например, последовательности ДНК, последовательности РНК, последовательности белка) и соответствующим библиографическим данным. Доступ к данным можно получить с помощью Entrez системы поиска данных, которая предоставляет..
Как загрузить несколько файлов FASTA/FASTQ
Добро пожаловать! К настоящему времени вы должны быть в состоянии настроить инструмент SRA и загрузить хотя бы один файл FASTA/FASTQ. Как вы заметили, если нет, то под одной статьей несколько файлов.
Итак, как я могу загрузить несколько файлов за один раз?
Вам повезло! В этой главе я расскажу о нескольких методах, которые вы можете использовать для загрузки нескольких файлов.
Вариант 1. Запуск нескольких экранов терминала
Это может быть немного трудоемко, так как вам нужно..
Вопросы по теме 'bioinformatics'
Python: консенсус и профиль Розалинды
Я пытаюсь решить задачу «Консенсус и профиль» на Розалинде. Инструкции по вызову следующие:
Дано: набор не более 10 строк ДНК одинаковой длины (не более 1 кб) в формате FASTA.
Возврат: согласованная строка и матрица профиля для коллекции....
25.04.2024
Новые материалы
Я хотел выучить язык программирования MVC4, но не мог выучить его раньше, потому что это выглядит сложно…
Просто начните и учитесь самостоятельно
Я хотел выучить язык программирования MVC4, но не мог выучить его раньше, потому что он кажется мне сложным, и я бросил его. Это в основном инструмент..
Лицензии с открытым исходным кодом: руководство для разработчиков и создателей
В динамичном мире разработки программного обеспечения открытый исходный код стал мощной парадигмой, способствующей сотрудничеству, инновациям и прогрессу, движимому сообществом. В основе..
Объяснение документов 02: BERT
BERT представил двухступенчатую структуру обучения: предварительное обучение и тонкая настройка.
Во время предварительного обучения модель обучается на неразмеченных данных с помощью..
Как проанализировать работу вашего классификатора?
Не всегда просто знать, какие показатели использовать
С развитием глубокого обучения все больше и больше людей учатся обучать свой первый классификатор. Но как только вы закончите..
Работа с цепями Маркова, часть 4 (Машинное обучение)
Нелинейные цепи Маркова с агрегатором и их приложения (arXiv)
Автор : Бар Лайт
Аннотация: Изучаются свойства подкласса случайных процессов, называемых дискретными нелинейными цепями Маркова..
Crazy Laravel Livewire упростил мне создание электронной коммерции (панель администратора и API) [Часть 3]
Как вы сегодня, ребята?
В этой части мы создадим CRUD для данных о продукте. Думаю, в этой части я не буду слишком много делиться теорией, но чаще буду делиться своим кодом. Потому что..
Использование машинного обучения и Python для классификации 1000 сезонов новичков MLB Hitter
Чему может научиться машина, глядя на сезоны новичков 1000 игроков MLB? Это то, что исследует это приложение.
В этом процессе мы будем использовать неконтролируемое обучение, чтобы..